Il borgo mercantile di San Candido sorge nel punto in cui il Rio di Sesto proveniente dalle Dolomiti orientali sfocia nella Drava. Il territorio comunale comprende cinque frazioni che si estendono sul fondovalle, esclusa Monte San Candido posta sul versante vallivo settentrionale. Il limite comunale a est segna anche il confine con l´Austria in località Prato alla Drava. A sud il comune si estende fino alle Dolomiti di Sesto (Parco naturale) e raggiunge i 3000 m con le cime Rocca dei Baranci, Punta Tre Scarperi e Croda dei Baranci. Grazie alla favorevole posizione geografica e all´infrastuttura stradale e ferroviaria San Candido è il centro principale dell´Alta Pusteria.