San Martino sorge su una terrazza nel mezzo della Val Badia sovrastato da Castel Torre. L´ampio territorio comunale occupa il versante orientale della valle, si estende verso sudovest con la Val di Longiarù ( e l´omonima frazione) fino al Corno di Putia e alle Odle e sale dopo Antermoia verso ovest le pendici del Passo delle Erbe. Il paesaggio di questa valle è disseminato di caratteristici gruppi di masi. Sede comunale è Piccolino sul fondovalle. La strada che attraversa il paese e quella fortemente trafficata nei mesi estivi che porta al Passo delle Erbe non incidono come negli altri comuni badioti.